O Terceiro Esquadrão do Terceiro Grupo de Aviação, o Esquadrão Flecha, foi criado no dia 11 de fevereiro de 2004 na Base Aérea de Campo Grande, Mato Grosso do Sul, absorvendo parte do efetivo e aeronaves da extinta Segunda Esquadrilha de Ligação e Observação (2ª ELO), da Base Aérea de Santa Cruz, no Rio de Janeiro. Apesar disso, a sua criação não foi apenas uma mudança de nome, mas o surgimento de um Esquadrão de Caça, com missões e características muito diferentes da 2ª ELO. Uma de suas missões mais importantes é a vigilância da fronteira oeste do Brasil, uma imensa região aérea, que abrange as fronteiras com o Paraguai e Bolívia, complementando o trabalho do 1º/3º GAv - Esquadrão Escorpião de Boa Vista, em Roraima e o 2º/3º GAv - Esquadrão Grifo, de Porto Velho, em Rondônia. Ambos atuam no patrulhamento aéreo das fronteiras brasileiras. Outra importante missão do Esquadrão Flecha é a de ser uma unidade de formação de Líderes de Esquadrilhas de Caça da Força Aérea Brasileira. O Esquadrão Flecha iniciou as suas atividades operando aeronaves Embraer T-27 Tucano e sua versão de ataque ao solo A-27. No dia 12 de maio de 2006 o Esquadão recebeu os quatro primeiros A-29 Super Tucanos, que voam atualmente em conjunto com os A-27.